主要区别是，性质不同、特点不同、应用不同。
一、性质不同
1、燃料油
燃料油主要由石油的裂化残渣油和直馏残渣油制成的。
2、燃油是用于燃油发动机的燃料，主要分汽油和柴油两种。柴油主要由原油蒸馏、催化裂化、热裂化、加氢裂化、石油焦化等过程生产的柴油馏分调配而成。汽油由石油炼制得到的直馏汽油组分、催化裂化汽油组分、催化重整汽油组分等不同汽油组分经精制后与高辛烷值组分经调和制得。
二、特点不同
1、燃料油
其特点是粘度大，含非烃化合物、胶质、沥青质多。
2、柴油特点是能量密度高，燃油消耗率低。汽油重要的特性为蒸发性、抗爆性、安定性、和腐蚀性。
三、应用不同
1、燃料油
①、电力行业的燃料油消费主要用于燃油发电、供热机组，燃煤机组的点火，助燃和稳燃用油。
②、钢铁行业消费的燃料油主要用于加热炉、自备电厂发电供热和耐火材料等方面。
③、建材行业消耗的燃料油主要用于平板玻璃和建筑卫生陶瓷的生产，随着产品质量要求的提高，一部分高档产品生产将会逐步转向天然气和液化石油气为燃料。
④、石油化工行业的燃料油使用主要在自备电厂的发电、油田生活采暖、炼油厂生产工艺用热、化肥厂生产用原料和燃料以及其他化工生产。