主要研究所一共有十二个。
绵阳九院，即中国工程物理研究院，其主要院属科研所及所在地如下：
流体物理研究所（一所）——所在地：绵阳市科学城
核物理与化学研究所（二所）——所在地：绵阳市科学城
化工材料研究所（三所）——所在地：绵阳市科学城
总体工程研究所（四所）——所在地：绵阳市科学城（）
电子工程研究所（五所）——所在地：绵阳市科学城
机械制造工艺研究所（六所）——所在地：绵阳市科学城
材料研究所（七所）——所在地：绵阳江油市
激光聚变研究所（八所）——所在地：绵阳市科学城
科学计算研究所（九所）——所在地：北京市海淀区
应用电子学研究所（十所）——所在地：绵阳市科学城
上海等离子体研究所（十一所）——所在地：上海市
计算机应用研究所（十二所）——所在地：绵阳市科学城。