1、出自姬姓，为周武王姬发的后代，以国名为氏。据《新唐书·宰相世系表》所载，西周初年，周武王克商后，大举分封诸侯，其第二个儿子邘叔被封在邘国。后来，邘叔的子孙就以国名为氏，有的姓了邘，有的则去邑旁姓于，是为河南于氏。春秋战国混乱，邘叔有后裔迁山东郯城，为山东于氏。
2、出自古炎帝姜姓齐国公子、文学家淳于髡的后裔淳于氏，在唐代时避讳宪宗李纯改单姓于氏。据《古今姓氏书辩证》所载，淳于公子孙，以国名为姓，称为淳于氏。唐贞观年间所定皇族七姓，有淳于氏。至唐宪宗李纯时，为避讳（“纯”“淳”同音），复姓淳于氏改为单姓于氏。到了宋代，又有部分于姓恢复淳于姓，也有一部沿袭未改的，形成此支于氏。
3、出自北魏前期的鲜卑万忸于氏，在孝文帝汉化改革时，改为于姓。
4、出自赐姓或少数民族改于姓而来，明朝时赐元人巴延达哩姓于名忠，清朝时，南方的部分尼玛哈氏改于姓。又有达斡尔、鄂伦春、土、回、高丽等小数民族有改于姓者。